Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP19Q99542 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms