Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5RAP2Q96SN8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms