Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms