Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP1Q96S65 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP1Q96S65 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms