Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRRC1Q96M27 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms