Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms