Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf42Q96LP6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf42Q96LP6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms