Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HIC2Q96JB3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HIC2Q96JB3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms