Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC34Q96HJ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC34Q96HJ3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms