Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms