Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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