Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPTQ96BT3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms