Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms