Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms