Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms