Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF3AQ92664 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms