Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms