Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TRIM41Q8WV44 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms