Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms