Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF398Q8TD17 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms