Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL11Q8NHH1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms