Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARRDC4Q8NCT1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARRDC4Q8NCT1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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