Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HJURPQ8NCD3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms