Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF182Q8N6D2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF182Q8N6D2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF182Q8N6D2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF182Q8N6D2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF182Q8N6D2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF182Q8N6D2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF182Q8N6D2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF182Q8N6D2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF182Q8N6D2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms