Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRBD1Q8N5C6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms