Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM2Q8N271 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM2Q8N271 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms