Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z2

ABRA, Actin-binding Rho-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAQ8N0Z2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAQ8N0Z2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms