Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXNDC2Q86VQ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TXNDC2Q86VQ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXNDC2Q86VQ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXNDC2Q86VQ3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXNDC2Q86VQ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXNDC2Q86VQ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXNDC2Q86VQ3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms