Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4DQ86TL0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms