Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBE2Q1Q7Z7E8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2Q1Q7Z7E8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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