Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms