Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP27Q6ZUM4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms