Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM43BQ6ZT52 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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