Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC129Q6ZRS4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms