Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms