Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HACD2Q6Y1H2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms