Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHISA2Q6UWI4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHISA2Q6UWI4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms