Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A10Q6U841 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms