Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms