Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF613Q6PF04 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF613Q6PF04 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF613Q6PF04 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF613Q6PF04 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF613Q6PF04 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF613Q6PF04 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF613Q6PF04 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF613Q6PF04 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms