Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms