Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms