Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms