Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIRMAQ69YN4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIRMAQ69YN4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms