Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGNBP1Q5YKI7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGNBP1Q5YKI7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms