Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM29Q5VYK3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM29Q5VYK3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms