Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MALRD1Q5VYJ5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MALRD1Q5VYJ5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MALRD1Q5VYJ5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MALRD1Q5VYJ5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MALRD1Q5VYJ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MALRD1Q5VYJ5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MALRD1Q5VYJ5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms