Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM78Q5T7P6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TMEM78Q5T7P6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TMEM78Q5T7P6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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TMEM78Q5T7P6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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