Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms