Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms